Chorobę powodują wirusy. Żółta karłowatość cebuli występuje we wszystkich krajach uprawiających cebulę. Pospolita jest również Polsce szczególnie na cebuli nasiennej. Poza cebulą wirus poraża również szalotkę a z roślin ozdobnych szafirki, narcyzy i żonkile. Plon cebuli konsumpcyjnej z porażonych plantacji może być niższy nawet o 35 %. Porażone cebule źle zimują i przedwcześnie wydają szczypior. Plon nasion może obniżyć się nawet o 80%.

Choroba objawia się wyraźnymi żółtymi lub jasnozielonymi smugami widocznymi na szczypiorze. Szczypior jest spłaszczony, pofałdowany a jego końce załamują się i dotykają ziemi. Szyjka cebul grubieje. Pędy nasienne mają również żółte pasy i smugi, poza tym są powyginane i wyraźnie krótsze od zdrowych.

Z roku na rok wirus przenoszony jest wraz z wysadkami oraz dymką. Na plantacjach rozprzestrzeniają go mszyce. Może też przenosić się przez ocieranie się roślin zdrowych o chore.

Profilaktyka polega na wysadzaniu na plantacjach nasiennych i z dymki cebul zdrowych, pochodzących ze zdrowych plantacji. Cebulę z siewu i z rozsady należy uprawiać w odległości co najmniej 200 metrów od cebuli nasiennej i z dymki. Chore rośliny należy jak najszybciej ostrożnie usunąć z pola. Usunięte rośliny najlepiej spalić lub głęboko zakopać. Systematyczne zwalczanie mszyc na plantacji cebuli znacznie ogranicza rozprzestrzenianie się choroby