Integrowana ochrona roślin obowiązuje rolników od 1 stycznia 2014 roku. Jest połączeniem wszystkich metod ochrony roślin przed organizmami szkodliwymi, tj. chwastami, chorobami, szkodnikami, minimalizującymi zagrożenie dla środowiska oraz zdrowia ludzi i zwierząt. W pierwszej kolejności należy zastosować metody niechemiczne. Jednak w przypadku znacznego zagrożenia plonu i opłacalności produkcji integrowana ochrona pozwala na włączenie chemicznej regulacji populacji agrofagów.

Do metod niechemicznych zaliczamy:

• metodę agrotechniczną, gdzie podstawowe znaczenie mają działania profilaktyczne, do których należą: prawidłowy płodozmian, dbałość o żyzność gleby, zdrowy materiał siewny, dobór odmian odpornych lub tolerancyjnych, prawidłowy termin i normy wysiewu, odpowiedni dobór stanowiska;
• metodę mechaniczną polegającą na stosowaniu różnego rodzaju barier izolujących roślinę od agrofaga, np. opaski lepowe, pułapki chwytne, stosowanie przynęt, a także bezpośrednie niszczenie chwastów za pomocą bronowania;
• metodę fizyczną, gdzie wykorzystywana jest wysoka temperatura do odkażania gleby, materiału siewnego i nasadzeniowego, a także niska temperatura w przechowalnictwie, czy też różne formy energii do zwalczania szkodników magazynowych, np. światło zwabiające motyle do lamp owadobójczych;
• metodę biologiczną opartą na ochronie miejscowych gatunków pożytecznych, wprowadzeniu do upraw wrogów naturalnych, wykorzystaniu mikroorganizmów antagonistycznych w stosunku do patogenów roślin uprawnych, a także mikroorganizmów chorobotwórczych dla szkodników.

Metoda chemiczna polega na stosowaniu syntetycznych środków ochrony roślin w celu regulacji występowania agrofagów w sposób ograniczający ryzyko powstania odporności u organizmów szkodliwych, w sposób bezpieczny dla środowiska oraz zdrowia ludzi i zwierząt.

Zdrowy materiał siewny jest ważnym elementem metody agrotechnicznej w integrowanej ochronie roślin. Stosowanie odpowiedniego i zdrowego materiału siewnego daje podstawę do uzyskania dobrego plonu. Materiał siewny jest często zaprawiany przeciwko chorobom takim jak: fuzariozy, śniecie, głownie oraz jest wolny od zanieczyszczeń. Udział (%) czynników agrotechnicznych w kształtowaniu plonów roślin polowych – dane szacunkowe dla przeciętnych warunków klimatyczno-glebowych w Polsce – przedstawia się następująco:

Jak wynika z powyższego zestawienia, udział w plonie odmiany (15-20%), czyli kwalifikowanego materiału siewnego, jest wyższy niż udział ochrony roślin (10-15%).

W Polsce kwalifikowany materiał siewny jest stosowany w gospodarstwach na poziomie 20%, co powoduje plony poniżej potencjału wykazywanego w doświadczeniach odmianowych. W Europie średni poziom jego stosowania w produkcji wynosi 50%, a plony są bardziej zbliżone do tych uzyskiwanych w doświadczeniach. Stosowanie kwalifikowanego materiału siewnego jest jednym z tańszych sposobów zwiększania produkcji rolnej. Warunkuje też wykorzystanie postępu hodowlanego zawartego w nowych odmianach roślin uprawnych. Wykorzystanie do siewu ziarna kwalifikowanego zapewnia wysiew nasion jednolitych pod względem pochodzenia, odmiany, odpowiadający normom czystości i zdrowotności. Nasiona przeznaczone do siewu powinny charakteryzować się: czystością co najmniej 98%, zdolnością kiełkowania nie mniejszą niż 98%, wysoką masą 1000 ziaren oraz dobrą zdrowotnością. Wysoka jakość materiału siewnego decyduje o pełnych i wyrównanych wschodach, prawidłowym wzroście i rozwoju roślin oraz o wzroście plonów. Kwalifikowany materiał siewny zapewnia także obniżenie kosztów produkcji poprzez uzyskanie oszczędności z tytułu mniejszych ilości wysiewu, zmniejszenie kosztów ochrony poprzez wyższą odporność na choroby i szkodniki.

W warunkach integrowanej ochrony roślin zdrowe nasiona i odmiany o wysokiej odporności są głównymi składnikami nowoczesnych technologii. Odporność odmian co najmniej 7-stopniowa przyczynia się do stosowania mniejszych ilości środków ochrony roślin i pozwala chronić bioróżnorodność środowiska rolniczego.